8.х УПП проведение комплектации склад в ТЧ

По мимо проводок там ещё движения по куче регистров учета остатков товаров нужно делать.

Для чего? У вас комплектующие списываются сразу с нескольких складов или появляется новая номенклатура на нескольких складах?

Учить мат. часть. или хотя бы с начало задать вопрос о том как это можно сделать и целесообразно ли это делать. А уже потом:

А движения по регистрам Учета затрат(УУ,БУ) делать не нужно?
А как тогда себестоимость списания партий со склада будете определять? Себестоимость рассчитывать?

Открывали и не единожды....

В чём проблема завести промежуточный склад "Сборочный цех" и на него перемещать комплектующие перед сборкой?

Ну смотрите вариантов несколько, на мой взгляд - самы менее трудо затратный и с точки зрения времени и изменения конфигурации - это делать через подписку на событие.
Допустим ПриПроведении.

У Вас уже будут движения на этот момент вы получаете ТЧ вашего документа обходите коллекцию движений по нужному регистру и меняете склад или тупо ощищаете старые и делаете свои.

Проводки формируются процедурами общего модуля "УправлениеЗапасамиРасширеннаяАналитика" это для РАУЗ. Если партионка то другой общий модуль.

Ну просто так у вас общие модули трогать не надо. тем боле в общих модулях там для всех документов. там вам тогда придется прописывать проверку на тип документа, что типа если
Регистратор=Тип("") тогда .....
что бы изменения не каснулись других доков