КДиР оплаты через платежые карты

Здравствуйте! Программа 1С 8.2 Бухгалтерия. Организация на УСН - розничная торговля. Проданный товар списывается через "реализацию товаров и услуг" (пока не введена штрих-кодовая система) далее на основание реализации делается приходный кассовый ордер (операция "оплата от покупателя") с суммой фактически сданной продавцом в кассу. (например по кассовой ленте пробито на сумму 6 434, в кассу сдается 5500 остальное прошло через терминал - платежную карту). Далее вручную вводится операция Дт 57.03 Кт 62.01 - 1 066,5 (сумма прошедшая через терминал). Вопрос в том, что при формирование КДиР непонятно списываются расходы - если в ПКО сумма 5500 расходы на 434 руб, если ставишь сумму 6400 - 532 руб, если 8000,00 - расходы на еще большую сумму, причем практически весь товар списанный через реализацию оплачен поставщику. Это первое, что непонятно - как же списываются расходы.
Второе - сумма прошедшая через терминал, когда поступает на расчетный счет в КДиР в расходы попадает тольо банковское обслуживание и только, ни какая себестоимость товара не списывается.

Пожалуйста помогите, очень надо и как всегда срочно - простаивает работа

Получается, что в КДиР попадают расходы пропорционально сумме отраженной в ПКО. А как быть если часть выручки за день - это нал, часть безнал (платежная карта). И еще такой момент: у нс продавцы сдают не всю выручку, оставляют мелкие деньги на конец смены текущего дня, соответственно на начало дня следуещего

То, что вводится операцией вручную - никак не отражается в КУДиР.
Попробуйте всё таки оформлять документы не через Реализацию, а через Отчет о розничных продажах.. На копии базы проверните пару ваших операций и проверьте, как оно будет попадать.